胃肠外科是集医疗、教学、科研为一体的专业化胃肠外科疾病诊疗中心，专业覆盖大多数腹部外科疾病，包括胃肠道疾病、肛肠疾病、急腹症、疝与腹壁疾病、消化道肿瘤及临床营养支持等，以微创手术技术治疗胃癌、结直肠癌、疝为特色，拥有良好的专业人才梯队，科室人员技术精湛，手术水平先进。
目前开展胃肠道疾病、胃肠道肿瘤、腹腔和后腹腔肿瘤、各种疝、肠瘘、肛门及其周围疾病、各种体表肿瘤、肠内外营养等诊疗工作。腹腔镜手术治疗胃肠疾病、胃肠肿瘤的技术达到省内先进水平。腹腔镜手术治疗腹腔、后腹腔囊性肿瘤及骶前皮脂腺囊肿等居国内先进水平。
胃肠外科本着一切为病人服务的原则，运用医院作为北京白求恩医学专家临床基地的资源优势，每周都有来自北京大学肿瘤医院、中国人民解放军总医院、中国医学科学院肿瘤医院等多位北京肿瘤专家对肿瘤患者提供多学科协作会诊服务，通过综合多学科专家会诊意见，确定最佳诊治方案，使患者能够得到最准确的治疗，从而实现规范化精准治疗。
